Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ISXQ2M1V0 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ISXQ2M1V0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ISXQ2M1V0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ISXQ2M1V0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ISXQ2M1V0 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ISXQ2M1V0 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ISXQ2M1V0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ISXQ2M1V0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ISXQ2M1V0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ISXQ2M1V0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ISXQ2M1V0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ISXQ2M1V0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ISXQ2M1V0 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ISXQ2M1V0 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ISXQ2M1V0 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ISXQ2M1V0 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ISXQ2M1V0 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ISXQ2M1V0 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ISXQ2M1V0 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ISXQ2M1V0 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ISXQ2M1V0 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ISXQ2M1V0 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ISXQ2M1V0 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ISXQ2M1V0 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ISXQ2M1V0 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ISXQ2M1V0 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ISXQ2M1V0 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ISXQ2M1V0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ISXQ2M1V0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ISXQ2M1V0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ISXQ2M1V0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ISXQ2M1V0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ISXQ2M1V0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ISXQ2M1V0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ISXQ2M1V0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ISXQ2M1V0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ISXQ2M1V0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ISXQ2M1V0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ISXQ2M1V0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ISXQ2M1V0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ISXQ2M1V0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ISXQ2M1V0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ISXQ2M1V0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ISXQ2M1V0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ISXQ2M1V0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ISXQ2M1V0 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ISXQ2M1V0 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ISXQ2M1V0 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ISXQ2M1V0 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ISXQ2M1V0 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ISXQ2M1V0 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ISXQ2M1V0 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ISXQ2M1V0 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ISXQ2M1V0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ISXQ2M1V0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ISXQ2M1V0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms