Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms