Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDB1Q16531 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDB1Q16531 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
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