Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP10Q15642 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms