Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYTH1Q15438 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms