Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE3CQ15386 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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