Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRRQ15256 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms