Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB3GAP1Q15042 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB3GAP1Q15042 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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