Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNIP1Q15025 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNIP1Q15025 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNIP1Q15025 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TNIP1Q15025 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNIP1Q15025 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TNIP1Q15025 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNIP1Q15025 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNIP1Q15025 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNIP1Q15025 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNIP1Q15025 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNIP1Q15025 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNIP1Q15025 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNIP1Q15025 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNIP1Q15025 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNIP1Q15025 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNIP1Q15025 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNIP1Q15025 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNIP1Q15025 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNIP1Q15025 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms