Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAPTM4AQ15012 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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