Protein–RNA interactions for Protein: Q14CS0

UBXN2B, UBX domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2BQ14CS0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBXN2BQ14CS0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms