Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COL19A1Q14993 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms