Protein–RNA interactions for Protein: Q14781

CBX2, Chromobox protein homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX2Q14781 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CBX2Q14781 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CBX2Q14781 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CBX2Q14781 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CBX2Q14781 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CBX2Q14781 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CBX2Q14781 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CBX2Q14781 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CBX2Q14781 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CBX2Q14781 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CBX2Q14781 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CBX2Q14781 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CBX2Q14781 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CBX2Q14781 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CBX2Q14781 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CBX2Q14781 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CBX2Q14781 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms