Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CBFBQ13951 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
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CBFBQ13951 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBFBQ13951 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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