Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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