Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EXOSC2Q13868 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms