Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PKP1Q13835 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
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