Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP1A4Q13733 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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