Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ATRQ13535 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ATRQ13535 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ATRQ13535 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ATRQ13535 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ATRQ13535 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ATRQ13535 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ATRQ13535 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ATRQ13535 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ATRQ13535 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ATRQ13535 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ATRQ13535 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ATRQ13535 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ATRQ13535 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ATRQ13535 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ATRQ13535 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ATRQ13535 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ATRQ13535 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ATRQ13535 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
ATRQ13535 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
ATRQ13535 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
ATRQ13535 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
ATRQ13535 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ATRQ13535 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ATRQ13535 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ATRQ13535 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ATRQ13535 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ATRQ13535 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ATRQ13535 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ATRQ13535 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ATRQ13535 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ATRQ13535 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ATRQ13535 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ATRQ13535 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ATRQ13535 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ATRQ13535 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ATRQ13535 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ATRQ13535 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ATRQ13535 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ATRQ13535 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ATRQ13535 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ATRQ13535 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ATRQ13535 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ATRQ13535 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ATRQ13535 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ATRQ13535 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ATRQ13535 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ATRQ13535 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ATRQ13535 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ATRQ13535 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
ATRQ13535 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ATRQ13535 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
ATRQ13535 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ATRQ13535 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
ATRQ13535 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ATRQ13535 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ATRQ13535 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ATRQ13535 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATRQ13535 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATRQ13535 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATRQ13535 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
ATRQ13535 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATRQ13535 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
ATRQ13535 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATRQ13535 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATRQ13535 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATRQ13535 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATRQ13535 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATRQ13535 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATRQ13535 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATRQ13535 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATRQ13535 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATRQ13535 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
ATRQ13535 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATRQ13535 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATRQ13535 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
ATRQ13535 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
ATRQ13535 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATRQ13535 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATRQ13535 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATRQ13535 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
ATRQ13535 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
ATRQ13535 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATRQ13535 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATRQ13535 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATRQ13535 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATRQ13535 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATRQ13535 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATRQ13535 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
ATRQ13535 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATRQ13535 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATRQ13535 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATRQ13535 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATRQ13535 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATRQ13535 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATRQ13535 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ATRQ13535 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATRQ13535 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATRQ13535 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATRQ13535 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms