Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
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TCOF1Q13428 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
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TCOF1Q13428 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
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TCOF1Q13428 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
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TCOF1Q13428 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TCOF1Q13428 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TCOF1Q13428 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
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