Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE3BQ13370 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE3BQ13370 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
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