Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SP140Q13342 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SP140Q13342 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SP140Q13342 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SP140Q13342 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SP140Q13342 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SP140Q13342 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SP140Q13342 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SP140Q13342 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SP140Q13342 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SP140Q13342 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SP140Q13342 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SP140Q13342 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SP140Q13342 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SP140Q13342 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SP140Q13342 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SP140Q13342 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SP140Q13342 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SP140Q13342 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SP140Q13342 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SP140Q13342 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SP140Q13342 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SP140Q13342 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SP140Q13342 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SP140Q13342 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SP140Q13342 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SP140Q13342 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SP140Q13342 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SP140Q13342 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SP140Q13342 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SP140Q13342 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SP140Q13342 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SP140Q13342 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SP140Q13342 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SP140Q13342 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SP140Q13342 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SP140Q13342 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SP140Q13342 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SP140Q13342 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SP140Q13342 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SP140Q13342 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SP140Q13342 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SP140Q13342 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SP140Q13342 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SP140Q13342 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SP140Q13342 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SP140Q13342 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SP140Q13342 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SP140Q13342 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SP140Q13342 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SP140Q13342 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SP140Q13342 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SP140Q13342 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SP140Q13342 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SP140Q13342 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SP140Q13342 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SP140Q13342 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SP140Q13342 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SP140Q13342 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SP140Q13342 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SP140Q13342 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SP140Q13342 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SP140Q13342 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SP140Q13342 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SP140Q13342 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SP140Q13342 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SP140Q13342 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SP140Q13342 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SP140Q13342 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SP140Q13342 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SP140Q13342 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SP140Q13342 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SP140Q13342 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SP140Q13342 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SP140Q13342 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SP140Q13342 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SP140Q13342 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SP140Q13342 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SP140Q13342 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SP140Q13342 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SP140Q13342 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SP140Q13342 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SP140Q13342 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SP140Q13342 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SP140Q13342 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SP140Q13342 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SP140Q13342 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SP140Q13342 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SP140Q13342 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SP140Q13342 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SP140Q13342 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SP140Q13342 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SP140Q13342 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SP140Q13342 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SP140Q13342 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SP140Q13342 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SP140Q13342 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SP140Q13342 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SP140Q13342 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SP140Q13342 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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