Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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SKP2Q13309 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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SKP2Q13309 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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SKP2Q13309 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SKP2Q13309 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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