Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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