Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
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TRAF1Q13077 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAF1Q13077 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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TRAF1Q13077 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
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TRAF1Q13077 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAF1Q13077 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
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