Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMARCB1Q12824 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SMARCB1Q12824 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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