Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
PDE4CQ08493 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE4CQ08493 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms