Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DHX9Q08211 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms