Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD51Q06609 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms