Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRKCDQ05655 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms