Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE3AQ05086 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms