Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP1Q04837 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms