Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GBE1Q04446 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms