Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XPCQ01831 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XPCQ01831 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
XPCQ01831 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
XPCQ01831 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
XPCQ01831 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
XPCQ01831 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XPCQ01831 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
XPCQ01831 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
XPCQ01831 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
XPCQ01831 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
XPCQ01831 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
XPCQ01831 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
XPCQ01831 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
XPCQ01831 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XPCQ01831 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XPCQ01831 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XPCQ01831 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XPCQ01831 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XPCQ01831 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XPCQ01831 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
XPCQ01831 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
XPCQ01831 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
XPCQ01831 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
XPCQ01831 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XPCQ01831 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
XPCQ01831 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XPCQ01831 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XPCQ01831 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
XPCQ01831 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XPCQ01831 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XPCQ01831 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
XPCQ01831 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
XPCQ01831 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
XPCQ01831 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XPCQ01831 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XPCQ01831 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
XPCQ01831 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
XPCQ01831 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
XPCQ01831 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
XPCQ01831 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
XPCQ01831 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XPCQ01831 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XPCQ01831 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
XPCQ01831 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
XPCQ01831 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
XPCQ01831 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XPCQ01831 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XPCQ01831 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XPCQ01831 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XPCQ01831 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XPCQ01831 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XPCQ01831 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XPCQ01831 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XPCQ01831 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XPCQ01831 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XPCQ01831 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XPCQ01831 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XPCQ01831 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
XPCQ01831 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
XPCQ01831 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
XPCQ01831 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
XPCQ01831 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XPCQ01831 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
XPCQ01831 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XPCQ01831 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XPCQ01831 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XPCQ01831 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XPCQ01831 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
XPCQ01831 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
XPCQ01831 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
XPCQ01831 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
XPCQ01831 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
XPCQ01831 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
XPCQ01831 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XPCQ01831 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XPCQ01831 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
XPCQ01831 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XPCQ01831 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
XPCQ01831 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XPCQ01831 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
XPCQ01831 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XPCQ01831 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XPCQ01831 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
XPCQ01831 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XPCQ01831 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XPCQ01831 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XPCQ01831 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XPCQ01831 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XPCQ01831 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XPCQ01831 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XPCQ01831 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
XPCQ01831 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
XPCQ01831 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
XPCQ01831 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XPCQ01831 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XPCQ01831 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XPCQ01831 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
XPCQ01831 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XPCQ01831 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms