Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms