Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIM1P81133 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIM1P81133 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIM1P81133 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIM1P81133 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SIM1P81133 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIM1P81133 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIM1P81133 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIM1P81133 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SIM1P81133 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIM1P81133 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIM1P81133 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIM1P81133 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIM1P81133 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIM1P81133 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIM1P81133 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SIM1P81133 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIM1P81133 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIM1P81133 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIM1P81133 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIM1P81133 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIM1P81133 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIM1P81133 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIM1P81133 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIM1P81133 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIM1P81133 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIM1P81133 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIM1P81133 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIM1P81133 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIM1P81133 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIM1P81133 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIM1P81133 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIM1P81133 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIM1P81133 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIM1P81133 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SIM1P81133 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIM1P81133 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIM1P81133 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIM1P81133 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIM1P81133 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIM1P81133 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIM1P81133 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIM1P81133 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIM1P81133 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIM1P81133 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SIM1P81133 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIM1P81133 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SIM1P81133 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIM1P81133 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIM1P81133 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIM1P81133 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SIM1P81133 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIM1P81133 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIM1P81133 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIM1P81133 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIM1P81133 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIM1P81133 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIM1P81133 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SIM1P81133 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIM1P81133 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIM1P81133 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIM1P81133 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIM1P81133 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIM1P81133 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIM1P81133 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIM1P81133 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIM1P81133 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIM1P81133 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIM1P81133 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIM1P81133 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIM1P81133 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIM1P81133 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIM1P81133 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIM1P81133 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIM1P81133 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SIM1P81133 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIM1P81133 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIM1P81133 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIM1P81133 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIM1P81133 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIM1P81133 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIM1P81133 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIM1P81133 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIM1P81133 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIM1P81133 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIM1P81133 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SIM1P81133 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIM1P81133 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SIM1P81133 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIM1P81133 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIM1P81133 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SIM1P81133 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIM1P81133 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIM1P81133 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIM1P81133 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIM1P81133 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIM1P81133 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIM1P81133 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIM1P81133 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIM1P81133 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms