Protein–RNA interactions for Protein: P78509

RELN, Reelin, humanhuman

Predictions only

Length 3,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELNP78509 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RELNP78509 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RELNP78509 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RELNP78509 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RELNP78509 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RELNP78509 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RELNP78509 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RELNP78509 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RELNP78509 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RELNP78509 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RELNP78509 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RELNP78509 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RELNP78509 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RELNP78509 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RELNP78509 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RELNP78509 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RELNP78509 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RELNP78509 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RELNP78509 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RELNP78509 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RELNP78509 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RELNP78509 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RELNP78509 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RELNP78509 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RELNP78509 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RELNP78509 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RELNP78509 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RELNP78509 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RELNP78509 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RELNP78509 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RELNP78509 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RELNP78509 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RELNP78509 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RELNP78509 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RELNP78509 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RELNP78509 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RELNP78509 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RELNP78509 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RELNP78509 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RELNP78509 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RELNP78509 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RELNP78509 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RELNP78509 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RELNP78509 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RELNP78509 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RELNP78509 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RELNP78509 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RELNP78509 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RELNP78509 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RELNP78509 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RELNP78509 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RELNP78509 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RELNP78509 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RELNP78509 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RELNP78509 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RELNP78509 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RELNP78509 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RELNP78509 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RELNP78509 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RELNP78509 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RELNP78509 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RELNP78509 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RELNP78509 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RELNP78509 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RELNP78509 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RELNP78509 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RELNP78509 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RELNP78509 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RELNP78509 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RELNP78509 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RELNP78509 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RELNP78509 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RELNP78509 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RELNP78509 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RELNP78509 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RELNP78509 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RELNP78509 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RELNP78509 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RELNP78509 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RELNP78509 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RELNP78509 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RELNP78509 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RELNP78509 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RELNP78509 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RELNP78509 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RELNP78509 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RELNP78509 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RELNP78509 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RELNP78509 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RELNP78509 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RELNP78509 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RELNP78509 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RELNP78509 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RELNP78509 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RELNP78509 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RELNP78509 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RELNP78509 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RELNP78509 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RELNP78509 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RELNP78509 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms