Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNRPNP63162 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms