Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPL23P62829 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPL23P62829 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPL23P62829 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPL23P62829 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPL23P62829 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPL23P62829 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPL23P62829 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPL23P62829 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPL23P62829 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPL23P62829 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPL23P62829 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPL23P62829 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPL23P62829 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPL23P62829 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPL23P62829 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPL23P62829 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPL23P62829 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RPL23P62829 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RPL23P62829 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RPL23P62829 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RPL23P62829 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RPL23P62829 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RPL23P62829 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RPL23P62829 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RPL23P62829 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RPL23P62829 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RPL23P62829 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RPL23P62829 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RPL23P62829 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RPL23P62829 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RPL23P62829 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RPL23P62829 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RPL23P62829 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RPL23P62829 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RPL23P62829 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RPL23P62829 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RPL23P62829 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RPL23P62829 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RPL23P62829 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RPL23P62829 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RPL23P62829 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RPL23P62829 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RPL23P62829 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RPL23P62829 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RPL23P62829 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RPL23P62829 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RPL23P62829 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RPL23P62829 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RPL23P62829 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RPL23P62829 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RPL23P62829 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RPL23P62829 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RPL23P62829 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RPL23P62829 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RPL23P62829 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RPL23P62829 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RPL23P62829 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RPL23P62829 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RPL23P62829 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RPL23P62829 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RPL23P62829 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RPL23P62829 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RPL23P62829 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RPL23P62829 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RPL23P62829 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RPL23P62829 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RPL23P62829 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RPL23P62829 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RPL23P62829 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RPL23P62829 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RPL23P62829 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RPL23P62829 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RPL23P62829 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RPL23P62829 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RPL23P62829 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RPL23P62829 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RPL23P62829 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RPL23P62829 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RPL23P62829 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RPL23P62829 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RPL23P62829 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RPL23P62829 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RPL23P62829 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RPL23P62829 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RPL23P62829 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RPL23P62829 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RPL23P62829 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RPL23P62829 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RPL23P62829 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RPL23P62829 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RPL23P62829 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RPL23P62829 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RPL23P62829 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
RPL23P62829 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
RPL23P62829 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RPL23P62829 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
RPL23P62829 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RPL23P62829 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RPL23P62829 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms