Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms