Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms