Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP6P59044 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP6P59044 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP6P59044 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP6P59044 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP6P59044 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP6P59044 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP6P59044 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP6P59044 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP6P59044 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP6P59044 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP6P59044 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP6P59044 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP6P59044 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLRP6P59044 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP6P59044 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP6P59044 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP6P59044 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP6P59044 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP6P59044 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP6P59044 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP6P59044 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP6P59044 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP6P59044 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP6P59044 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP6P59044 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP6P59044 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP6P59044 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP6P59044 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP6P59044 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP6P59044 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP6P59044 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP6P59044 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP6P59044 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP6P59044 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLRP6P59044 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NLRP6P59044 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NLRP6P59044 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NLRP6P59044 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NLRP6P59044 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NLRP6P59044 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NLRP6P59044 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLRP6P59044 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms