Protein–RNA interactions for Protein: P54849

EMP1, Epithelial membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP1P54849 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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EMP1P54849 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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EMP1P54849 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EMP1P54849 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
EMP1P54849 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
EMP1P54849 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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