Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DAP3P51398 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DAP3P51398 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DAP3P51398 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DAP3P51398 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DAP3P51398 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DAP3P51398 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DAP3P51398 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
DAP3P51398 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
DAP3P51398 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
DAP3P51398 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DAP3P51398 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DAP3P51398 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DAP3P51398 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DAP3P51398 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DAP3P51398 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DAP3P51398 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DAP3P51398 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DAP3P51398 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DAP3P51398 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DAP3P51398 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DAP3P51398 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DAP3P51398 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DAP3P51398 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DAP3P51398 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DAP3P51398 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DAP3P51398 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DAP3P51398 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DAP3P51398 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DAP3P51398 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DAP3P51398 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DAP3P51398 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DAP3P51398 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DAP3P51398 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DAP3P51398 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DAP3P51398 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DAP3P51398 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DAP3P51398 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DAP3P51398 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DAP3P51398 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DAP3P51398 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DAP3P51398 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DAP3P51398 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DAP3P51398 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DAP3P51398 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DAP3P51398 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DAP3P51398 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DAP3P51398 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DAP3P51398 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DAP3P51398 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DAP3P51398 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DAP3P51398 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DAP3P51398 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DAP3P51398 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DAP3P51398 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DAP3P51398 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DAP3P51398 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DAP3P51398 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DAP3P51398 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DAP3P51398 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DAP3P51398 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DAP3P51398 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DAP3P51398 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DAP3P51398 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DAP3P51398 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DAP3P51398 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DAP3P51398 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DAP3P51398 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DAP3P51398 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DAP3P51398 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DAP3P51398 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DAP3P51398 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DAP3P51398 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DAP3P51398 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DAP3P51398 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DAP3P51398 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DAP3P51398 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DAP3P51398 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DAP3P51398 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DAP3P51398 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DAP3P51398 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DAP3P51398 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DAP3P51398 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DAP3P51398 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DAP3P51398 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DAP3P51398 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DAP3P51398 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DAP3P51398 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DAP3P51398 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DAP3P51398 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DAP3P51398 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DAP3P51398 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DAP3P51398 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DAP3P51398 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DAP3P51398 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DAP3P51398 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DAP3P51398 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DAP3P51398 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DAP3P51398 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DAP3P51398 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms