Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
POU3F4P49335 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms