Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIA4P48058 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms