Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAPZBP47756 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms