Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RECQLP46063 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RECQLP46063 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RECQLP46063 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RECQLP46063 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RECQLP46063 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RECQLP46063 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RECQLP46063 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RECQLP46063 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RECQLP46063 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RECQLP46063 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RECQLP46063 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RECQLP46063 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RECQLP46063 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RECQLP46063 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RECQLP46063 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RECQLP46063 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RECQLP46063 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RECQLP46063 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RECQLP46063 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RECQLP46063 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RECQLP46063 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RECQLP46063 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RECQLP46063 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RECQLP46063 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RECQLP46063 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RECQLP46063 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RECQLP46063 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RECQLP46063 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RECQLP46063 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RECQLP46063 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RECQLP46063 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RECQLP46063 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RECQLP46063 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RECQLP46063 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RECQLP46063 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RECQLP46063 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RECQLP46063 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RECQLP46063 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RECQLP46063 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RECQLP46063 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RECQLP46063 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RECQLP46063 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RECQLP46063 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RECQLP46063 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RECQLP46063 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RECQLP46063 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RECQLP46063 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RECQLP46063 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RECQLP46063 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RECQLP46063 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RECQLP46063 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RECQLP46063 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RECQLP46063 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RECQLP46063 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RECQLP46063 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RECQLP46063 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RECQLP46063 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RECQLP46063 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RECQLP46063 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RECQLP46063 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RECQLP46063 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RECQLP46063 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RECQLP46063 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RECQLP46063 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RECQLP46063 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RECQLP46063 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RECQLP46063 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RECQLP46063 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RECQLP46063 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RECQLP46063 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RECQLP46063 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RECQLP46063 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RECQLP46063 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RECQLP46063 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RECQLP46063 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RECQLP46063 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RECQLP46063 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RECQLP46063 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RECQLP46063 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RECQLP46063 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RECQLP46063 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RECQLP46063 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RECQLP46063 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RECQLP46063 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RECQLP46063 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RECQLP46063 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RECQLP46063 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RECQLP46063 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RECQLP46063 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RECQLP46063 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RECQLP46063 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RECQLP46063 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RECQLP46063 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RECQLP46063 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RECQLP46063 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RECQLP46063 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RECQLP46063 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RECQLP46063 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RECQLP46063 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms