Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD52P43351 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD52P43351 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD52P43351 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD52P43351 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD52P43351 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD52P43351 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD52P43351 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD52P43351 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD52P43351 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD52P43351 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD52P43351 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD52P43351 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD52P43351 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD52P43351 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD52P43351 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD52P43351 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD52P43351 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD52P43351 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD52P43351 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD52P43351 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD52P43351 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD52P43351 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD52P43351 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD52P43351 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD52P43351 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAD52P43351 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD52P43351 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD52P43351 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD52P43351 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD52P43351 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD52P43351 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD52P43351 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD52P43351 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD52P43351 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD52P43351 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD52P43351 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD52P43351 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD52P43351 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD52P43351 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD52P43351 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD52P43351 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD52P43351 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD52P43351 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD52P43351 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD52P43351 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD52P43351 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD52P43351 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD52P43351 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD52P43351 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD52P43351 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD52P43351 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD52P43351 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD52P43351 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD52P43351 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD52P43351 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD52P43351 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD52P43351 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD52P43351 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD52P43351 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD52P43351 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD52P43351 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD52P43351 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD52P43351 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD52P43351 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD52P43351 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD52P43351 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAD52P43351 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD52P43351 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD52P43351 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD52P43351 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD52P43351 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD52P43351 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD52P43351 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD52P43351 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD52P43351 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD52P43351 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD52P43351 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD52P43351 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD52P43351 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD52P43351 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD52P43351 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD52P43351 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD52P43351 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD52P43351 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD52P43351 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD52P43351 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD52P43351 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD52P43351 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD52P43351 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD52P43351 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD52P43351 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD52P43351 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD52P43351 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD52P43351 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD52P43351 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD52P43351 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD52P43351 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD52P43351 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAD52P43351 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms