Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTGER3P43115 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms